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Added missing Optional typings. Added default values for Ollama optional keys. --------- Co-authored-by: Bagatur <baskaryan@gmail.com>
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16 KiB
Python
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Python
from typing import Optional
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FULL_PROMPT = """# Context
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- Plate-based data is rectangular and could be situated anywhere within the dataset.
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- The first item in every row is the row index
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{hint}
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# Rules
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- Ignore all data which is not part of the plate.
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- Row identifiers start with a single letter of the alphabet.
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- The header row of the plate has monotonically increasing integers {col_range_str}.
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- The header row should NOT be considered the starting row of the plate.
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# Output
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- Use 0-indexing for row and column numbers.
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- Do NOT include the header row or header column in the output calcuation.
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- Produce your output as JSON. ONLY RETURN THE JSON. The format should be:
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```json
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{json_format}
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```
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""" # noqa: E50
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NUM_PLATES_PROMPT = """- There {num_plates_str} in this data."""
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ROWS_PROMPT = """- Each plate has {num_rows} rows."""
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COLS_PROMPT = """- Each plate has {num_cols} columns."""
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GENERIC_PLATES_PROMPT = """
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- There may be multiple plates.
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- Plate consist of 24 (4x6), 96 (8x12), 384 (16x24), or 1536 (32 x 48) wells.
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"""
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HUMAN_24W_PROMPT = "0,,,,,,,\n1,,1,2,3,4,5,6\n2,A,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006\n3,B,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006\n4,C,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006\n5,D,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006\n" # noqa: E501
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AI_24W_RESPONSE = '[{"row_start": 2, "row_end": 5, "col_start": 1, "col_end": 6, "contents": "SB_ID"}]' # noqa: E501
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HUMAN_96W_PROMPT = "0,,,,,,,,,,,,,\n1,,1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12\n2,A,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012\n3,B,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012\n4,C,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012\n5,D,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012\n6,E,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012\n7,F,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012\n8,G,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012\n9,H,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012\n" # noqa: E501
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AI_96W_RESPONSE = '[{"row_start": 2, "row_end": 9, "col_start": 1, "col_end": 12, "contents": "SB_ID"}]' # noqa: E501
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HUMAN_384W_PROMPT = "0,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,\n1,,1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24\n2,A,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024\n3,B,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024\n4,C,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024\n5,D,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024\n6,E,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024\n7,F,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024\n8,G,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024\n9,H,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024\n10,I,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024\n11,J,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024\n12,K,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024\n13,L,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024\n14,M,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024\n15,N,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024\n" # noqa: E501
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# should be 15, 23
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AI_384W_RESPONSE = '[{"row_start": 2, "row_end": 17, "col_start": 1, "col_end": 24, "contents": "SB_ID"}]' # noqa: E501
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HUMAN_1536W_PROMPT = "0,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,\n1,,1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28,29,30,31,32,33,34,35,36,37,38,39,40,41,42,43,44,45,46,47,48\n2,A,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024,SB-025,SB-026,SB-027,SB-028,SB-029,SB-030,SB-031,SB-032,SB-033,SB-034,SB-035,SB-036,SB-037,SB-038,SB-039,SB-040,SB-041,SB-042,SB-043,SB-044,SB-045,SB-046,SB-047,SB-048\n3,B,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024,SB-025,SB-026,SB-027,SB-028,SB-029,SB-030,SB-031,SB-032,SB-033,SB-034,SB-035,SB-036,SB-037,SB-038,SB-039,SB-040,SB-041,SB-042,SB-043,SB-044,SB-045,SB-046,SB-047,SB-048\n4,C,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024,SB-025,SB-026,SB-027,SB-028,SB-029,SB-030,SB-031,SB-032,SB-033,SB-034,SB-035,SB-036,SB-037,SB-038,SB-039,SB-040,SB-041,SB-042,SB-043,SB-044,SB-045,SB-046,SB-047,SB-048\n5,D,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024,SB-025,SB-026,SB-027,SB-028,SB-029,SB-030,SB-031,SB-032,SB-033,SB-034,SB-035,SB-036,SB-037,SB-038,SB-039,SB-040,SB-041,SB-042,SB-043,SB-044,SB-045,SB-046,SB-047,SB-048\n6,E,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024,SB-025,SB-026,SB-027,SB-028,SB-029,SB-030,SB-031,SB-032,SB-033,SB-034,SB-035,SB-036,SB-037,SB-038,SB-039,SB-040,SB-041,SB-042,SB-043,SB-044,SB-045,SB-046,SB-047,SB-048\n7,F,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024,SB-025,SB-026,SB-027,SB-028,SB-029,SB-030,SB-031,SB-032,SB-033,SB-034,SB-035,SB-036,SB-037,SB-038,SB-039,SB-040,SB-041,SB-042,SB-043,SB-044,SB-045,SB-046,SB-047,SB-048\n8,G,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024,SB-025,SB-026,SB-027,SB-028,SB-029,SB-030,SB-031,SB-032,SB-033,SB-034,SB-035,SB-036,SB-037,SB-038,SB-039,SB-040,SB-041,SB-042,SB-043,SB-044,SB-045,SB-046,SB-047,SB-048\n9,H,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024,SB-025,SB-026,SB-027,SB-028,SB-029,SB-030,SB-031,SB-032,SB-033,SB-034,SB-035,SB-036,SB-037,SB-038,SB-039,SB-040,SB-041,SB-042,SB-043,SB-044,SB-045,SB-046,SB-047,SB-048\n10,I,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024,SB-025,SB-026,SB-027,SB-028,SB-029,SB-030,SB-031,SB-032,SB-033,SB-034,SB-035,SB-036,SB-037,SB-038,SB-039,SB-040,SB-041,SB-042,SB-043,SB-044,SB-045,SB-046,SB-047,SB-048\n11,J,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024,SB-025,SB-026,SB-027,SB-028,SB-029,SB-030,SB-031,SB-032,SB-033,SB-034,SB-035,SB-036,SB-037,SB-038,SB-039,SB-040,SB-041,SB-042,SB-043,SB-044,SB-045,SB-046,SB-047,SB-048\n12,K,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024,SB-025,SB-026,SB-027,SB-028,SB-029,SB-030,SB-031,SB-032,SB-033,SB-034,SB-035,SB-036,SB-037,SB-038,SB-039,SB-040,SB-041,SB-042,SB-043,SB-044,SB-045,SB-046,SB-047,SB-048\n13,L,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024,SB-025,SB-026,SB-027,SB-028,SB-029,SB-030,SB-031,SB-032,SB-033,SB-034,SB-035,SB-036,SB-037,SB-038,SB-039,SB-040,SB-041,SB-042,SB-043,SB-044,SB-045,SB-046,SB-047,SB-048\n14,M,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024,SB-025,SB-026,SB-027,SB-028,SB-029,SB-030,SB-031,SB-032,SB-033,SB-034,SB-035,SB-036,SB-037,SB-038,SB-039,SB-040,SB-041,SB-042,SB-043,SB-044,SB-045,SB-046,SB-047,SB-048\n15,N,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024,SB-025,SB-026,SB-027,SB-028,SB-029,SB-030,SB-031,SB-032,SB-033,SB-034,SB-035,SB-036,SB-037,SB-038,SB-039,SB-040,SB-041,SB-042,SB-043,SB-044,SB-045,SB-046,SB-047,SB-048\n16,O,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024,SB-025,SB-026,SB-027,SB-028,SB-029,SB-030,SB-031,SB-032,SB-033,SB-034,SB-035,SB-036,SB-037,SB-038,SB-039,SB-040,SB-041,SB-042,SB-043,SB-044,SB-045,SB-046,SB-047,SB-048\n17,P,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024,SB-025,SB-026,SB-027,SB-028,SB-029,SB-030,SB-031,SB-032,SB-033,SB-034,SB-035,SB-036,SB-037,SB-038,SB-039,SB-040,SB-041,SB-042,SB-043,SB-044,SB-045,SB-046,SB-047,SB-048\n18,Q,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024,SB-025,SB-026,SB-027,SB-028,SB-029,SB-030,SB-031,SB-032,SB-033,SB-034,SB-035,SB-036,SB-037,SB-038,SB-039,SB-040,SB-041,SB-042,SB-043,SB-044,SB-045,SB-046,SB-047,SB-048\n19,R,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024,SB-025,SB-026,SB-027,SB-028,SB-029,SB-030,SB-031,SB-032,SB-033,SB-034,SB-035,SB-036,SB-037,SB-038,SB-039,SB-040,SB-041,SB-042,SB-043,SB-044,SB-045,SB-046,SB-047,SB-048\n20,S,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024,SB-025,SB-026,SB-027,SB-028,SB-029,SB-030,SB-031,SB-032,SB-033,SB-034,SB-035,SB-036,SB-037,SB-038,SB-039,SB-040,SB-041,SB-042,SB-043,SB-044,SB-045,SB-046,SB-047,SB-048\n21,T,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024,SB-025,SB-026,SB-027,SB-028,SB-029,SB-030,SB-031,SB-032,SB-033,SB-034,SB-035,SB-036,SB-037,SB-038,SB-039,SB-040,SB-041,SB-042,SB-043,SB-044,SB-045,SB-046,SB-047,SB-048\n22,U,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024,SB-025,SB-026,SB-027,SB-028,SB-029,SB-030,SB-031,SB-032,SB-033,SB-034,SB-035,SB-036,SB-037,SB-038,SB-039,SB-040,SB-041,SB-042,SB-043,SB-044,SB-045,SB-046,SB-047,SB-048\n23,V,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024,SB-025,SB-026,SB-027,SB-028,SB-029,SB-030,SB-031,SB-032,SB-033,SB-034,SB-035,SB-036,SB-037,SB-038,SB-039,SB-040,SB-041,SB-042,SB-043,SB-044,SB-045,SB-046,SB-047,SB-048\n24,W,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024,SB-025,SB-026,SB-027,SB-028,SB-029,SB-030,SB-031,SB-032,SB-033,SB-034,SB-035,SB-036,SB-037,SB-038,SB-039,SB-040,SB-041,SB-042,SB-043,SB-044,SB-045,SB-046,SB-047,SB-048\n25,X,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024,SB-025,SB-026,SB-027,SB-028,SB-029,SB-030,SB-031,SB-032,SB-033,SB-034,SB-035,SB-036,SB-037,SB-038,SB-039,SB-040,SB-041,SB-042,SB-043,SB-044,SB-045,SB-046,SB-047,SB-048\n26,Y,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024,SB-025,SB-026,SB-027,SB-028,SB-029,SB-030,SB-031,SB-032,SB-033,SB-034,SB-035,SB-036,SB-037,SB-038,SB-039,SB-040,SB-041,SB-042,SB-043,SB-044,SB-045,SB-046,SB-047,SB-048\n27,Z,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024,SB-025,SB-026,SB-027,SB-028,SB-029,SB-030,SB-031,SB-032,SB-033,SB-034,SB-035,SB-036,SB-037,SB-038,SB-039,SB-040,SB-041,SB-042,SB-043,SB-044,SB-045,SB-046,SB-047,SB-048\n28,AA,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024,SB-025,SB-026,SB-027,SB-028,SB-029,SB-030,SB-031,SB-032,SB-033,SB-034,SB-035,SB-036,SB-037,SB-038,SB-039,SB-040,SB-041,SB-042,SB-043,SB-044,SB-045,SB-046,SB-047,SB-048\n29,AB,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024,SB-025,SB-026,SB-027,SB-028,SB-029,SB-030,SB-031,SB-032,SB-033,SB-034,SB-035,SB-036,SB-037,SB-038,SB-039,SB-040,SB-041,SB-042,SB-043,SB-044,SB-045,SB-046,SB-047,SB-048\n30,AC,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024,SB-025,SB-026,SB-027,SB-028,SB-029,SB-030,SB-031,SB-032,SB-033,SB-034,SB-035,SB-036,SB-037,SB-038,SB-039,SB-040,SB-041,SB-042,SB-043,SB-044,SB-045,SB-046,SB-047,SB-048\n31,AD,SB-001,SB-002,SB-003,SB-004,SB-005,SB-006,SB-007,SB-008,SB-009,SB-010,SB-011,SB-012,SB-013,SB-014,SB-015,SB-016,SB-017,SB-018,SB-019,SB-020,SB-021,SB-022,SB-023,SB-024,SB-025,SB-026,SB-027,SB-028,SB-029,SB-030,SB-031,SB-032,SB-033,SB-034,SB-035,SB-036,SB-037,SB-038,SB-039,SB-040,SB-041,SB-042,SB-043,SB-044,SB-045,SB-046,SB-047,SB-048\n" # noqa: E501
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AI_1536W_RESPONSE = '[{"row_start": 2, "row_end": 33, "col_start": 1, "col_end": 48, "contents": "SB_ID"}]' # noqa: E501
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USER_EXAMPLE_DICT = {
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24: HUMAN_24W_PROMPT,
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96: HUMAN_96W_PROMPT,
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384: HUMAN_384W_PROMPT,
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1536: HUMAN_1536W_PROMPT,
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}
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AI_REPONSE_DICT = {
|
|
24: AI_24W_RESPONSE,
|
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96: AI_96W_RESPONSE,
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384: AI_384W_RESPONSE,
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1536: AI_1536W_RESPONSE,
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}
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def create_prompt(
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num_plates: Optional[int] = None,
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num_rows: Optional[int] = None,
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num_cols: Optional[int] = None,
|
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) -> str:
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additional_prompts = []
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if num_plates:
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num_plates_str = f"are {num_plates} plates" if num_plates > 1 else "is 1 plate"
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additional_prompts.append(
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NUM_PLATES_PROMPT.format(num_plates_str=num_plates_str)
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)
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if num_rows:
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additional_prompts.append(ROWS_PROMPT.format(num_rows=num_rows))
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|
if num_cols:
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|
additional_prompts.append(COLS_PROMPT.format(num_cols=num_cols))
|
|
return (
|
|
"\n".join(additional_prompts) if additional_prompts else GENERIC_PLATES_PROMPT
|
|
)
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